Tờ khai hải quan điện tử là gì? Cách khai trên VNACCS

Tờ khai hải quan điện tử là tờ khai được lập và gửi tới cơ quan hải quan qua hệ thống thông quan tự động, thay cho tờ khai giấy. Doanh nghiệp nhập dữ liệu trên phần mềm khai báo, ký bằng chữ ký số, truyền lên hệ thống, và nhận lại số tờ khai cùng kết quả phân luồng — thường trong vài phút.

ba thứ phải có trước khi khai được, quy trình Blue Sea sẽ chia sẻ 5 bước trên hệ thống, các mã nghiệp vụ IDA, EDA, IDC, EDC và vì sao khai báo thử với đăng ký chính thức là hai việc khác nhau, mã đơn vị hải quan mới bắt buộc dùng từ 01/7/2026, sáu lỗi hay gặp khi truyền, và cách sửa hoặc huỷ tờ khai đã truyền.

Trình tự làm thủ tục hải quan từ đầu tới cuối nằm ở bài thủ tục hải quan xuất nhập khẩu.

Tờ khai hải quan điện tử là gì?

Tờ khai hải quan điện tử là bản kê khai thông tin lô hàng được truyền tới cơ quan hải quan dưới dạng dữ liệu điện tử, có giá trị pháp lý như tờ khai giấy. Ở Việt Nam đây là hình thức khai mặc định cho gần như toàn bộ hàng hoá xuất nhập khẩu; tờ khai giấy chỉ còn dùng trong một số trường hợp được pháp luật cho phép, chẳng hạn khi hệ thống điện tử gặp sự cố.

Hệ thống tiếp nhận là hệ thống thông quan tự động của cơ quan hải quan, thường gọi tắt là VNACCS/VCIS. Doanh nghiệp không làm việc trực tiếp với hệ thống này mà qua một phần mềm khai báo trung gian đã được kết nối. Phổ biến nhất ở Việt Nam là ECUS, ngoài ra có phần mềm của các nhà cung cấp khác.

Về pháp lý, việc khai điện tử chịu sự điều chỉnh của Luật Hải quan 2014 cùng Thông tư 38/2015/TT-BTC được sửa đổi bởi Thông tư 39/2018/TT-BTC. Nội dung phải khai trên tờ khai — các loại tờ khai, bảng mã loại hình và từng chỉ tiêu thông tin. Nằm ở bài tờ khai hải quan bài này chỉ nói cách đưa các nội dung đó lên hệ thống.

Giao diện tờ khai hải quan điện tử được thực hiện trên hệ thống VNACCS VCIS
Giao diện tờ khai hải quan điện tử được thực hiện trên hệ thống VNACCS VCIS

Cần làm gì trước khi khai được tờ khai hải quan điện tử?

Doanh nghiệp không khai được tờ khai điện tử nếu thiếu bất kỳ thứ nào trong ba thứ dưới đây. Cả ba đều phải chuẩn bị trước, và thời gian chuẩn bị tính bằng ngày chứ không phải bằng giờ.  Đây là lý do lô hàng đầu tiên của một doanh nghiệp mới hay bị trễ.

Cần có Lấy ở đâu Lưu ý
Chữ ký số của doanh nghiệp Nhà cung cấp dịch vụ chứng thực chữ ký số Phải đăng ký chữ ký số đó với cơ quan hải quan mới dùng để khai được. Có chữ ký số dùng cho thuế không đồng nghĩa đã dùng được cho hải quan
Tài khoản trên hệ thống khai báo Đăng ký với cơ quan hải quan Gắn với mã số thuế doanh nghiệp
Phần mềm khai báo đã kết nối Nhà cung cấp phần mềm Phải cài đúng thông số kết nối và cập nhật bảng mã mới nhất

Với hàng nhập khẩu còn một thứ nữa phải sẵn sàng trước khi truyền: tài khoản nộp thuế điện tử. Không nộp được thuế thì tờ khai không thông quan, trong khi đồng hồ phí lưu bãi vẫn chạy.

Bộ chứng từ của lô hàng cũng phải đủ trước khi ngồi vào nhập liệu, vì phần lớn dữ liệu được chép từ đó: hoá đơn thương mại, phiếu đóng gói, vận đơn, và giấy chứng nhận xuất xứ nếu xin ưu đãi thuế. Danh sách theo từng loại lô hàng nằm ở bài chứng từ xuất khẩu checklist nhập khẩu.

Hệ thống các văn bản pháp lý Luật Hải quan và Thông tư hướng dẫn khai báo hải quan điện tử
Hệ thống các văn bản pháp lý Luật Hải quan và Thông tư hướng dẫn khai báo hải quan điện tử

Quy trình khai tờ khai hải quan điện tử trên hệ thống

Quy trình khai tờ khai hải quan điện tử gồm năm bước, từ lúc mở tờ khai mới tới lúc nhận kết quả phân luồng. Năm bước này giống nhau về bản chất với cả hàng xuất và hàng nhập, chỉ khác ở loại tờ khai chọn ở bước đầu và ở một số trường dữ liệu.

Bước 1: Mở tờ khai mới và chọn đúng mã loại hình

Sau khi đăng nhập phần mềm bằng tài khoản doanh nghiệp, việc đầu tiên là chọn đúng loại tờ khai xuất khẩu hay nhập khẩu và chọn đúng mã loại hình cho lô hàng.

Mã loại hình phản ánh bản chất giao dịch: nhập để bán lại, nhập nguyên liệu để sản xuất xuất khẩu, tạm nhập tái xuất, và các trường hợp khác.

Chọn sai ở bước này không sửa được bằng cách chỉnh vài trường về sau phần lớn phải huỷ tờ khai và khai lại từ đầu. Bảng mã loại hình đầy đủ và cách chọn nằm ở bài tờ khai hải quan.

Bước 2: Nhập thông tin chung của lô hàng

Phần thông tin chung gồm dữ liệu về các bên tham gia, về vận tải và về địa điểm: người xuất khẩu, người nhập khẩu, mã số thuế, số vận đơn, tên phương tiện, cảng xếp, cảng dỡ, và mã địa điểm lưu kho hàng chờ thông quan.

Mã đơn vị hải quan tiếp nhận và mã địa điểm lưu kho là hai trường bắt buộc và cũng là hai trường dễ sai nhất, vì chúng là mã tra bảng chứ không phải chép từ chứng từ. Sai mã ở đây thì tờ khai bị từ chối ngay khi truyền, hoặc hàng được đưa về sai nơi.

Bước 3: Nhập danh sách hàng hoá và thông tin container

Phần danh sách hàng hoá khai từng dòng hàng: tên hàng, mã HS, xuất xứ, số lượng, đơn vị tính, đơn giá và trị giá. Tên hàng khai trên hệ thống phải thống nhất với tên trên hóa đơn và vận đơn  lệch nhau là lý do bị chuyển mức kiểm tra phổ biến nhất.

Với hàng đi container phải nhập thêm số container và số chì. Nguyên tắc áp mã hàng nằm ở bài mã HS là gì, và phần khai trị giá phụ thuộc điều kiện giao hàng ghi trong hợp đồng, cách các điều kiện phân chia chi phí nằm ở bài Incoterms 2020.

Bước 4: Khai báo thử để hệ thống trả về số thuế

Khai báo thử là thao tác gửi dữ liệu lên hệ thống để hệ thống kiểm tính hợp lệ và tính ra số thuế dự tính phải nộp, nhưng chưa đăng ký tờ khai. Hệ thống trả về một bản tạm kèm cảnh báo nếu dữ liệu có vấn đề.

Đây là bước để đối chiếu: số thuế hệ thống tính có khớp với số doanh nghiệp tự tính không. Lệch nhau nghĩa là có trường dữ liệu sai thường là mã HS, trị giá hoặc xuất xứ và phải sửa trước khi đi tiếp. Bỏ qua việc đối chiếu ở bước này là cách nhanh nhất để đăng ký một tờ khai sai số thuế.

Bước 5: Đăng ký chính thức và nhận kết quả phân luồng

Đăng ký chính thức là thao tác làm cho tờ khai có hiệu lực pháp lý. Hệ thống cấp số tờ khai, ghi nhận ngày đăng ký, và trả về kết quả phân luồng cho lô hàng.

Kết quả phân luồng cho biết lô hàng được thông quan ngay, phải kiểm tra hồ sơ, hay phải kiểm tra thực tế hàng hoá. Cách nhận biết và cách giảm tỉ lệ bị kiểm tra nằm ở bài phân luồng hải quan. Từ thời điểm đăng ký chính thức, tờ khai bắt đầu chạy thời hạn hiệu lực 15 ngày.

Các mã nghiệp vụ IDA, EDA, IDC, EDC và vì sao phải tách hai bước

Người khai làm việc với hệ thống qua các mã nghiệp vụ. Biết các mã này là biết tờ khai của mình đang ở trạng thái nào, kể cả khi việc khai do nhân viên hoặc đại lý thực hiện.

Bước Việc làm Mã nghiệp vụ Tờ khai đã tồn tại chưa
1 Nhập dữ liệu và truyền lên hệ thống để lấy phản hồi — chưa đăng ký chính thức, còn sửa được IDA (nhập) · EDA (xuất) Chưa
2 Hệ thống trả bản tạm kèm số thuế dự tính; người khai kiểm lại toàn bộ Chưa
3 Đăng ký chính thức tờ khai IDC (nhập) · EDC (xuất) Rồi
4 Hệ thống cấp số tờ khai và trả kết quả phân luồng Rồi
5 Khai bổ sung sau khi đã đăng ký chính thức IDA01 (nhập) · EDA01 (xuất) Rồi

 Nhiều người tưởng truyền dữ liệu lên hệ thống là đã có tờ khai. Thực tế, bước IDA hoặc EDA chỉ cho ra một bản tạm và một con số thuế dự tính chưa có tờ khai nào tồn tại về mặt pháp lý. Doanh nghiệp dừng ở đó rồi đi làm việc khác, tới lúc hàng cập cảng mới phát hiện chưa đăng ký, là tình huống có thật và tốn nhiều ngày để xử lý.

Vì sao hệ thống tách hai bước: bước khai báo thử cho bạn xem trước hệ thống hiểu tờ khai của bạn thế nào và tính ra bao nhiêu tiền thuế, trước khi cam kết chính thức. Đó là cơ chế an toàn duy nhất hệ thống cho bạn. Đăng ký thẳng mà bỏ qua bước kiểm tra là tự bỏ cơ chế đó.

Nguyên tắc an toàn: chỉ chuyển sang IDC hoặc EDC khi số thuế hệ thống tính đã khớp với số doanh nghiệp tự tính, và mọi cảnh báo ở bước khai thử đã xử lý hết. Đăng ký sớm không giúp hàng đi nhanh hơn, nhưng đăng ký với dữ liệu sai thì phải huỷ để làm lại.

Danh mục mã nghiệp vụ đầy đủ nằm trong tài liệu hướng dẫn hệ thống của cơ quan hải quan và có thể được cập nhật. Bảng trên là các mã dùng thường xuyên nhất.

Bảng phân biệt các mã nghiệp vụ IDA EDA IDC EDC trong hệ thống thông quan tự động
Bảng phân biệt các mã nghiệp vụ IDA EDA IDC EDC trong hệ thống thông quan tự động

Mã đơn vị hải quan mới từ 01/7/2026 và việc phải làm với phần mềm

Từ ngày 01/7/2026, ngành hải quan áp dụng thống nhất trên toàn quốc bộ mã đơn vị hải quan cùng bộ mã kho, bãi, địa điểm mới. Nguyên nhân gốc là việc sắp xếp lại tổ chức ngành theo Nghị định 29/2025/NĐ-CP, khi 35 Cục Hải quan khu vực được gộp thành 20 Chi cục Hải quan khu vực.

Lưu ý: cơ quan hải quan không tiếp nhận đăng ký tờ khai mới theo mã đơn vị hải quan cũ đã được điều chỉnh. Tờ khai xuất khẩu, nhập khẩu và tờ khai vận chuyển độc lập phát sinh từ mốc trên tại các đơn vị có thay đổi mã đều phải khai theo mã mới. Khai bằng mã cũ thì hệ thống từ chối ngay, và lỗi này dễ bị hiểu nhầm thành lỗi kết nối phần mềm.

Việc doanh nghiệp phải làm:

  • Cập nhật bảng mã trong phần mềm khai báo: Cả mã đơn vị hải quan lẫn mã kho, bãi, địa điểm. Không phải phần mềm nào cũng tự cập nhật; nhiều nơi phải tải bảng mã mới về.
  • Đồng bộ lại thông tin tài khoản nộp thuế theo mã chi cục mới, nếu không thì tiền thuế nộp vào không khớp với tờ khai.
  • Sửa các biểu mẫu nội bộ đang ghi tên hoặc mã cơ quan hải quan cũ: Giấy uỷ quyền, mẫu hợp đồng dịch vụ, mẫu tờ trình.

Một thay đổi hẹp hơn nhưng rất mới: từ ngày 09/9/2026, cơ quan hải quan triển khai trên toàn quốc chức năng tự động xác nhận tờ khai qua khu vực giám sát cho một số tờ khai xuất nhập khẩu của doanh nghiệp chế xuất, giảm thao tác thủ công ở khâu này. Nội dung này chỉ áp dụng cho doanh nghiệp chế xuất, không áp dụng cho hàng kinh doanh thông thường.

Các lỗi hay gặp và cách xử lý khi truyền tờ khai điện tử

Sáu lỗi dưới đây chiếm phần lớn các trường hợp tờ khai không truyền được hoặc bị từ chối. Đều là lỗi dữ liệu hoặc lỗi cấu hình, không phải lỗi hệ thống — nên gọi bộ phận kỹ thuật của phần mềm trước khi kiểm lại dữ liệu thường là mất thời gian.

Lỗi Nguyên nhân thường gặp Cách xử lý
Hệ thống từ chối mã đơn vị hải quan Phần mềm còn dùng bảng mã cũ Cập nhật bảng mã mới nhất rồi khai lại
Chữ ký số không ký được Chữ ký số chưa đăng ký với cơ quan hải quan, hoặc đã hết hạn Kiểm hạn của chứng thư số, và kiểm đã đăng ký với hải quan chưa
Số thuế hệ thống tính lệch với số tự tính Sai mã HS, sai trị giá, hoặc sai xuất xứ Đối chiếu lại ba trường đó ở bước khai thử, đừng chuyển sang IDC hoặc EDC
Tên hàng không khớp chứng từ Chép tắt hoặc dịch lại tên hàng khi nhập liệu Chép đúng tên trên hoá đơn, không tự rút gọn
Không nộp được thuế Tài khoản nộp thuế điện tử chưa sẵn sàng hoặc hết hạn mức Kiểm tài khoản và hạn mức tại ngân hàng trước khi truyền
Truyền được nhưng không thấy số tờ khai Mới dừng ở IDA hoặc EDA, chưa đăng ký chính thức Thực hiện bước IDC hoặc EDC

Lỗi cuối trong bảng là lỗi tốn kém nhất, vì nó không báo gì cả: doanh nghiệp tưởng đã xong và chỉ phát hiện khi hàng đã đến cảng. Các lỗi ở tầng quy trình rộng hơn nằm ở bài sai lầm thủ tục hải quan.

Màn hình thông báo lỗi kết nối hoặc sai định dạng dữ liệu khi truyền tờ khai hải quan
Màn hình thông báo lỗi kết nối hoặc sai định dạng dữ liệu khi truyền tờ khai hải quan

Cách sửa và huỷ tờ khai hải quan điện tử đã truyền

Sau khi tờ khai đã đăng ký chính thức, dữ liệu không còn sửa tự do được nữa. Có hai đường xử lý, và chọn đường nào phụ thuộc vào chỉ tiêu bị sai chứ không phụ thuộc vào việc doanh nghiệp muốn cách nào.

Khai bổ sung: thực hiện bằng mã IDA01 hoặc EDA01 dùng khi sai ở các chỉ tiêu không làm thay đổi bản chất giao dịch, chẳng hạn sai số vận đơn, sai tên phương tiện, hoặc sai một thông tin mô tả. Tờ khai gốc vẫn tồn tại, nội dung được sửa bằng một hồ sơ khai bổ sung.

Huỷ tờ khai dùng khi sai ở chỉ tiêu làm thay đổi bản chất giao dịch: Điển hình là sai mã loại hình hoặc khi lô hàng không thực hiện nữa. Huỷ tờ khai có điều kiện và thời hạn riêng, và không phải trường hợp nào cũng huỷ được. Chi tiết nằm ở bài huỷ tờ khai hải quan.

Thời điểm phát hiện quyết định mức độ phiền phức. Lỗi phát hiện trước bước IDC hoặc EDC thì sửa gần như miễn phí. Lỗi phát hiện sau khi đăng ký chính thức thì tốn phí, tốn thời gian, và ghi vào lịch sử tuân thủ của doanh nghiệp. Phát hiện sau khi hàng đã thông quan thì nên chủ động khai báo và nộp bổ sung, vì tự khai báo trước khi bị kiểm tra được xem xét giảm nhẹ hơn so với bị phát hiện khi kiểm tra sau thông quan.

Câu hỏi thường gặp khi làm tờ khai hải quan điện tử

Doanh nghiệp mới mất bao lâu để khai được tờ khai đầu tiên?

Thời gian phụ thuộc khâu chuẩn bị chứ không phải khâu nhập liệu. Chữ ký số và việc đăng ký chữ ký số đó với cơ quan hải quan, cộng với đăng ký tài khoản và cài đặt phần mềm, thường tính bằng ngày. Riêng thao tác nhập một tờ khai đơn giản chỉ mất vài chục phút khi chứng từ đã đủ.

Có bắt buộc dùng phần mềm của một nhà cung cấp cụ thể không?

Không. Doanh nghiệp dùng phần mềm nào cũng được, miễn phần mềm đó kết nối được với hệ thống của cơ quan hải quan. Điều quan trọng hơn tên phần mềm là bảng mã trong đó có được cập nhật hay không.

Khai sai rồi truyền đi thì có bị phạt ngay không?

Không phải mọi sai sót đều bị xử phạt. Sai ở bước IDA hoặc EDA thì không phát sinh gì vì tờ khai chưa tồn tại. Sau khi đăng ký chính thức, mức độ xử lý phụ thuộc chỉ tiêu sai, thời điểm phát hiện, và việc doanh nghiệp có chủ động khai báo hay không.

Tờ khai điện tử có cần in ra không?

Tờ khai điện tử có giá trị pháp lý ở dạng dữ liệu. Tuy vậy bản in vẫn cần trong nhiều tình huống tác nghiệp ở cảng và kho, và cần lưu trong hồ sơ của lô hàng để phục vụ kiểm tra sau thông quan.

Một tài khoản khai được cho nhiều doanh nghiệp không?

Tài khoản gắn với mã số thuế của doanh nghiệp. Đơn vị dịch vụ làm thủ tục cho nhiều khách hàng thì khai theo uỷ quyền của từng chủ hàng, và trách nhiệm pháp lý về nội dung khai vẫn thuộc về chủ hàng.

Khai xong bao lâu thì có kết quả phân luồng?

Hệ thống trả kết quả ngay sau bước đăng ký chính thức, thường trong vài phút. Nếu chờ lâu bất thường thì kiểm lại xem đã thực hiện IDC hoặc EDC chưa, trước khi nghĩ tới lỗi hệ thống.

Blue Sea Logistics khai tờ khai hải quan cho hàng xuất nhập khẩu tại các cửa khẩu chính ở TP.HCM, Hà Nội và Hải Phòng. Với lô hàng đầu tiên của một doanh nghiệp, chúng tôi đối chiếu số thuế ở bước khai báo thử trước khi đăng ký chính thức bước này ngăn được phần lớn các trường hợp phải huỷ tờ khai làm lại.

Xem phạm vi công việc tại trang dịch vụ hải quan, hoặc gọi 0902 972 959 để trao đổi về lô hàng cụ thể.

Đánh giá post
Nguyễn Thanh Tuấn
Nguyễn Thanh Tuấn
CEO Nguyễn Thanh Tuấn – Founder & CEO BlueSea với 12+ năm kinh nghiệm điều hành vận tải quốc tế, nội địa từng giữ vị trí quản lý tại các hãng tàu lớn, đã tư vấn thủ tục hải quan và tối ưu chi phí logistics cho 500+ doanh nghiệp xuất nhập khẩu.